В 08:55 (мск) члены экипажа длительной экспедиции МКС-54/55 попрощались с коллегами и перешли на борт «Союз МС-07», а в 12:16 (мск) корабль отстыковался от МКС.
На МКС продолжил работу экипаж в составе Эндрю Фойстела (командир экспедиции, США), Олега Артемьева (Россия) и Ричарда Арнольда (США). Уже 6 июня с космодрома Байконур на корабле «Союз МС-09» стартовала следующая экспедиция на МКС в составе российского космонавта Сергея Прокопьева (командир экипажа) и астронавтов Александера Герста (бортинженер, командир МКС-57, Германия) и Серины Ауньон-Чэнселлор (бортинженер, США).